Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms