Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms