Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHP1Q99653 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms