Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGAP1Q96PV0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms