Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms