Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms