Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP400Q96L91 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EP400Q96L91 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms