Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms