Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG2BQ96BY7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms