Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HGDQ93099 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HGDQ93099 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HGDQ93099 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms