Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3CQ92520 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms