Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms