Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSAMQ8N6F7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms