Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms