Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBLN3Q6UW01 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBLN3Q6UW01 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBLN3Q6UW01 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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