Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF449Q6P9G9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF449Q6P9G9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF449Q6P9G9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF449Q6P9G9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF449Q6P9G9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF449Q6P9G9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF449Q6P9G9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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