Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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MED27Q6P2C8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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MED27Q6P2C8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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MED27Q6P2C8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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MED27Q6P2C8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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MED27Q6P2C8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED27Q6P2C8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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