Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms