Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms