Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms