Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms