Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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