Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms