Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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