Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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