Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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