Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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