Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms