Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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