Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms