Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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