Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms