Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLCA4Q14CN2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLCA4Q14CN2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLCA4Q14CN2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLCA4Q14CN2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms