Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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