Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms