Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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