Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERV3-1Q14264 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERV3-1Q14264 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms