Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL9A3Q14050 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL9A3Q14050 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL9A3Q14050 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL9A3Q14050 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL9A3Q14050 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL9A3Q14050 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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