Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB1Q14028 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms