Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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