Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms