Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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