Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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