Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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