Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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