Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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