Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms