Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA4Q13439 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms