Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SP140Q13342 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP140Q13342 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP140Q13342 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP140Q13342 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP140Q13342 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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