Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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